Absolutamente. A tecnologia mNGS (sequenciamento metagenômico de nova geração) pode detectar simultaneamente DNA e RNA, o que é uma de suas vantagens mais significativas em relação aos métodos de teste tradicionais. Essa combinação de testes para patógenos de DNA e RNA é frequentemente referida como mNGS (para patógenos de DNA) + RNA-Seq (para patógenos de RNA) e, na prática clínica, é frequentemente referida coletivamente como "sequenciamento metagenômico de patógenos."

O seguinte explica seus princípios, vantagens e cenários de aplicação em detalhes:

1. Como alcançar a co-detecção de DNA e RNA?

A co-detecção não é simplesmente uma questão de colocar uma amostra em uma máquina; requer um processo laboratorial específico:

Extração de ácido nucleico da amostra: Primeiro, o ácido nucleico total (incluindo DNA e RNA) é extraído de amostras clínicas (como sangue, líquido cefalorraquidiano e líquido de lavagem broncoalveolar) usando um kit de extração especializado.

Transcrição reversa (etapa chave): A transcriptase reversa é adicionada ao ácido nucleico total extraído para retrotranscrever todo o RNA (humano e patogênico) em DNA complementar (cDNA).

Construção da Biblioteca de Sequenciamento: Neste ponto, todo o material genético da amostra é convertido em DNA (DNA original + cDNA retrotranscrito do RNA). Este DNA é então fragmentado, com adaptadores adicionados e processado usando um kit universal de construção de biblioteca para construir uma biblioteca pronta para sequenciamento.

Sequenciamento de Alto Rendimento e Análise Bioinformática: Após o sequenciamento de alto rendimento da biblioteca, a enorme quantidade de dados gerados passa por pipelines bioinformáticos especializados:

Remoção de Sequências Humanas: Sequências pertencentes ao genoma humano são alinhadas e filtradas para reduzir o volume de dados e melhorar a sensibilidade analítica.

Comparação Taxonômica: As sequências restantes são comparadas com um vasto banco de dados de microrganismos patogênicos (incluindo bactérias, vírus de DNA, vírus de RNA, fungos, parasitas e muito mais).

Geração de Relatório: Um relatório é gerado, listando todos os patógenos suspeitos detectados (incluindo vírus de DNA e RNA) e fornecendo informações relevantes sobre a contagem de leituras.

2. As Vantagens Significativas da Co-testagem de DNA/RNA

Amplo espectro e livre de hipóteses: Eliminando a necessidade de patógenos pré-especificados, um único teste pode rastrear todos os patógenos potenciais em uma amostra, incluindo vírus desconhecidos, raros e emergentes (por exemplo, SARS-CoV-2 e novos Bunyavírus, descobertos por meio desta tecnologia).

Eficiente e Abrangente: Um único teste pode cobrir quase todos os patógenos, tornando-o particularmente adequado para o diagnóstico etiológico rápido em pacientes criticamente doentes, de difícil diagnóstico, com infecções mistas e imunocomprometidos, evitando o processo demorado de teste tradicional "um por um".

Descoberta de Patógenos Inesperados: Patógenos não considerados clinicamente antes podem frequentemente ser descobertos, fornecendo novos insights diagnósticos.

3. Principais Cenários de Aplicação

Esta tecnologia geralmente não é a escolha de primeira linha, mas desempenha um papel fundamental quando os métodos tradicionais não conseguem identificar claramente a causa:

Febre de Origem Desconhecida (FUO)

Infecção intracraniana de origem desconhecida (como meningite, encefalite)

Pneumonia de origem desconhecida (especialmente em pacientes criticamente doentes e imunocomprometidos)

Diagnóstico etiológico de choque séptico

Diagnóstico de infecções oportunistas

4. Limitações

Alto Custo: O sequenciamento e a análise de dados são caros.

Altos Requisitos Técnicos: Requer hardware laboratorial extremamente alto, procedimentos operacionais e capacidades de análise bioinformática.

Dificuldade em distinguir entre colonização e infecção: Detectar uma sequência microbiana não garante que ela seja a culpada; os médicos devem fazer uma avaliação abrangente com base nos sintomas, sinais e outros resultados de testes do paciente.

Problemas de Sensibilidade: Algumas amostras com baixas cargas de patógenos podem perder a detecção.

Em resumo, a tecnologia mNGS, por meio da etapa chave de "transcrição reversa", permite com sucesso a detecção simultânea de patógenos de DNA e RNA. É uma ferramenta poderosa e imparcial de triagem de patógenos que desempenha um papel insubstituível no diagnóstico de infecções difíceis e críticas e é um avanço importante na tecnologia moderna de diagnóstico médico.