Resumo

A sequência de um tumor no nível do ADN transforma uma única amostra de tecido num mapa das mutações que conduzem a doença.O painel de instabilidade de 12 genes e microssatélites (MSI) aplica sequenciamento de próxima geração baseado em amplicões para descobrir as alterações que determinam se os medicamentos direcionados funcionarãoEste design focado dá às equipas de oncologia uma instantânea genómica rápida e económica sem o custo de um painel muito grande.

Como funciona

O ensaio enriquece e sequencia doze genes relacionados com o cancro, incluindo EGFR, KRAS, BRAF, ALK e MET, diretamente a partir de tecido fixado em formalina e incorporado em parafina (FFPE).A preparação da biblioteca usa a reação em cadeia da polimerase múltipla para amplificar as regiões alvoApós o sequenciamento, as tubulações de bioinformática alinham leituras, chamam variantes de nucleotídeo único e pequenas inserções ou exclusões,e calcular o estado MSI comparando a distribuição de comprimento dos loci repetitivos com uma referência estávelUm relatório lista então cada variante detectada com sua posição genômica, frequência alélica e uma anotação de relevância clínica extraída de bancos de dados públicos de variantes.

Indicações

Os médicos ordenam este painel para pacientes com câncer de pulmão não de células pequenas avançado que precisam de uma imagem genómica focada antes de se comprometerem com a terapia.É adequado para casos em que um painel amplo é desnecessário, mas a confirmação dos condutores mais acionáveis é necessáriaO componente MSI acrescenta valor para os doentes que estão a ser considerados para imunoterapia, porque um MSI elevado prevê a resposta aos inibidores do ponto de controlo em todos os tipos de tumor.

Especimens e comunicação

Um bloco de FFPE ou 510 lâminas não manchadas fornecem dados suficientes para o ensaio.e os resultados são apresentados como um PDF estruturado com tabelas de variantes e um resumo de interpretaçãoA reextracção é possível quando a quantidade inicial de ácido nucleico cai abaixo do limiar validado.

Armazenamento e aprovisionamento

Os rolos de tecido devem ser enviados à temperatura ambiente com dessecante, enquanto o ácido nucleico extraído viaja no gelo seco para preservar a integridade.A submissão por lotes reduz o custo por amostra e a programação do laboratórioO Give Life Time International suporta a repetição de pedidos e a logística consolidada para grupos que executam o painel em volume.

Perguntas frequentes

P: Que genes estão incluídos no painel de 12 genes?O painel abrange EGFR, KRAS, BRAF, ALK, MET e outros condutores de câncer de pulmão de alta frequência selecionados por sua ligação estabelecida com terapias aprovadas.

P: Como é determinado o estado de MSI a partir do mesmo ensaio?A conduta mede o deslizamento em locais repetitivos e compara a distribuição de comprimento observada com uma referência estável, classificando a amostra como MSS, MSI-L ou MSI-H.

P: Que quantidade de amostra é necessária quando o tecido é escasso?São geralmente suficientes cinco a dez slides de FFPE sem manchas, e a etapa de biblioteca baseada em PCR tolera uma entrada menor do que os métodos de exoma inteiro.

P: O relatório pode orientar a selecção da terapia dirigida de primeira linha?Sim. As variantes sensibilizantes detectadas, como as deleções do exônio 19 do EGFR ou as fusões de ALK, são relatadas com associações terapêuticas para apoiar decisões de primeira linha.